Сформирован 27.08.1894 года, как 16-й Саперный батальон. (ПВМ200) Фактически составлен к 21.09.1894 г. в г. Вильно. (ЦГШ26)
в составе:
- 1-я саперная рота , поступила рота 2-го Саперного батальона; [1864]
- 2-я саперная рота , поступила рота 3-го Саперного батальона; []
- 3-я саперная рота , поступила рота 4-го Саперного батальона; []
- военно-телеграфная рота , сформирована 09.05.1897 г. (ЦГШ142) (ПВМ51)
   с 1910 г. - 4-я телеграфная рота.
Вошел в состав 2-й Саперной бригады. Расквартирован в г. Вильна (Виленский ВО). (РСВ)
15.05.1895 г. - батальону установлено старшинство с 27.08.1894 года. (ПВМ108)
06.05.1897 г. - Пожаловано знамя , образца 1883 года с образом Святого Ферапонта Белозерского. (ЗЗ) Скоба на древко знамени с надписью:

  1894. 16-й Саперный баталiонъ.
       1897. 16-го Сапернаго баталiона. (ПСЗРИ38.600-1912)

26.06.1899 г. - Всем нижним чинам частей, расположенных в Виленском Военном округе, присвоены фуражки с козырьком. (ПВМ181)
27.09.1904 г. - одна рота переведена в 1-й Восточно-Сибирский Саперный батальон, взамен сформирована новая. (ШИ)
1905 г. - Японская война: в сотаве 16-го армейского корпуса отправлен на Дальний Восток. (РСВ)
К 06.04.1906 г. - Приведен в состав мирного времени. Возвращен в состав бригады. (ЦГШ419) Расквартирован в г. Вилина (Виленский ВО).(РСВ)
08.06.1907 г. - Пожалованы за войну с Японией знаки на головные уборы "За отличiе въ 1905 году". (ВП)
В 1910 году при упразднении Саперных бригад, вошел в состав 16-го армейского корпуса. Расквартирован в г. Казань (Казанский ВО).

Мировая война: с 02.08.1914 г. - 16-й армейский корпус в составе 4-й армии (Юго-Западный фронт).
30.08.1914 г. - корпус передан в 9-ю армию (Юго-Западный фротн). (ПЮЗф72)
18.09.1914 г. - возвращен в 4-ю армию (Юго-Западный фронт). (ПЮЗф99)
11.05.1915 г. - корпус, в составе 4-й армии, передан в подчинение Командующему Северо-Западного фронта. (ПСЗф166-с)
С 11.08.1915 г. - при разделении Северо Западного фронта, 4-я армия вошла в состав Западного фронта (ПВГ687)
В октября 1915 г. - 16-й армейский корпус направлен в 7-ю армию.
В ноябре корпус доукомплектовывается в г. Тирасполе (СОч.5 г.1)
С 13.12.1915 г. - 7-я армия на Юго-Западном фронте.
15.02.1916 г. - Батальон переформирован по новому штату из 4-х саперных, телеграфной и прожекторной рот. Сформирована 4-я саперная рота. (ПШВГ201)
На 22.12.1916 г. - корпус выведен в резерв и находится в тылу на стыке 7-й и 8-й армий (Юго-Западный фронт).
С начала 1917 г. - 16-й Инженерный полк. (ПШВГ1669-1916)
04.04.1917 г. - Приказано, знамя, с вензелем, отрекшегося императора, доставить в Петроград, для выполнения работ по снятию вензеля. (ПВМ182)
К 08.06.1917 г. - 16-й армейский корпус в составе 8-й армии (Юго-Западный фронт) (СОч.7 г.3)

Примечание:
[1854] - год формирования роты.